Keskeinen ero: katolinen Raamattu sisältää alkuperäiset neljäkymmentäkuusi Vanhan testamentin kirjaa (joka sisältää seitsemän Apokrypan kirjaa) ja kaksikymmentäseitsemän uutta testamenttia. Protestanttinen Raamattu sisältää vain Vanhan testamentin kolmekymmentäyhdeksän kirjaa ja kaksikymmentäseitsemän uutta testamenttia.
Suurin ero katolisten ja protestanttisten kirkkojen välillä on heidän uskomuksensa Raamattuihin. Katolilaiset katsovat Raamatun olevan yhtä suuri kuin kirkko ja perinne, kun taas protestantit katsovat Raamattua uskossa ja käytännössä korkeimpana auktoriteettina.
On huomattava, että Raamattu ei ole vain yksi kirja; se on kokoelma kirjoja kirjoituksista historiallisiin tapahtumiin. Se on Jeesuksen, hänen apostoliensa ja heidän elämänsä tarinoita käsittelevä kirjasto, kun Jeesus kuoli ristillä. Neljännen vuosisadan loppupuolella nämä erilaiset volyymit ja tarinat täytettiin yhdeksi tilavuudeksi, joka on pohjimmiltaan nykyaikainen Raamattu, kuten tiedämme. Moderni Raamattu koostuu kahdesta osasta: Vanhan testamentin ja Uuden testamentin.
Sekä katoliset että protestanttiset Raamatut sisältävät Uuden testamentin samassa muodossa. Ero syntyy Vanhassa testamentissa. Vanhassa testamentissa, joka oli mukana protestanttisessa Raamatussa, tehtiin opetuksia tai kirjoja. Canonisointi on prosessi, jossa valitaan, mitkä kirjat tulisi pysyä ja tulla osaksi Raamattua ja jotka olisi jätettävä pois. Protestanttinen Raamattu sisältää vain ne kirjat, joita pidettiin Jumalan sanoina. Kirjat ja tarinat, joiden katsottiin kirjoittaneen "mies", suljettiin pois. Tämä kanonointimenetelmä kesti vuosisatoja.
Vanha testamentti alkuperäisessä Raamatussa perustui juutalaisen kirjeen kreikkalaiseen käännökseen, jota kutsutaan Septuagintiksi. Noin 100 jKr. Juutalaisten rabbit tarkistivat Raamattuaan ja perustivat virallisen juutalais-kanonin, joka jätti osan Kreikan Septuagintin osista.
Poistetut kirjat olivat Tobit, Judith, 1 Maccabees, 2 Makababea, viisaus (Salomosta), Sirach ja Baruch. Myös osa olemassa olevista kirjoista poistettiin, mukaan lukien Psalmi 151 (Psalmista), osa Esterin kirjaa, Susanna (Danielista luvusta 13) ja Bel ja Dragon (Danielista luvusta 14).
Rooman katolinen kirkko ei kuitenkaan seurannut protestanttien askelia ja jatkoi vanhan testamentin perustamista Septuagintiin. Periaatteessa katolinen Raamattu sisältää edelleen alkuperäiset Vanhan testamentin neljäkymmentäkuusi kirjaa (joka sisältää seitsemän Apokrypan kirjaa) ja kaksikymmentäseitsemän Uuden testamentin kirjaa. Protestanttinen Raamattu puolestaan sisältää nyt Vanhan testamentin kolmekymmentäyhdeksän kirjaa ja kaksikymmentäseitsemän uutta testamenttia.