Tärkein ero: Vetypommin ja atomipommin ensisijainen ero on se, että atomipommi käytti ydinfissiota luoden energialohkon, kun taas vetypommi käyttää ydinfuusiota. Vetypommi on kauaskantoisempi ja vaarallisempi kuin atomipommi.
Yksi suurimmista kehittyneistä atomipommeista on jopa 500 kilotonnin TNT: n tuhoamisvoima. Verrattuna ensimmäiseen atomipommiin, jota käytettiin sodankäynnissä Japanissa Hiroshimassa vuonna 1945, oli 15 kilotonnia TNT: tä. Vaikka atomipommi on huono, vetypommi on vielä pahempi. Se pystyy vahingoittamaan paljon enemmän kuin atomipommi. Voimakkaimmin tähän päivään asti kehittyneellä vetypommilla on 15000 kilotonnin räjähdystuotto, joka on tuhannen kertaa pahempi kuin ensimmäinen atomipommi. Teknisesti ottaen ei ole mitään rajoitusta vetypommin räjäytystuotolle, mikä tekee siitä vielä vaarallisemman.
Molemmat ovat ydinaseiden tyyppejä, jotka tunnetaan myös yleisesti joukkotuhoaseina. Molemmat pystyvät tuhoutumaan suuresti; kuitenkin ne eroavat tavalla, jolla he reagoivat saadakseen tämän sanotun tuhon. Atomipommi on eräänlainen fissiopohjainen ydinase, joka tarkoittaa pohjimmiltaan sitä, että se käyttää fissioreaktiota lämmön ja energian luomiseksi. Täällä energia syntyy koottamalla rikastettua uraania tai plutoniumia ylikriittiseen massaan ja sitten joko ampumalla yksi osa kriittistä materiaalia toiseen, jota kutsutaan pistoolimenetelmäksi, tai puristamalla räjähtäviä linssejä alikriittisellä alueella materiaalia, joka käyttää kemiallisia räjähteitä moninkertaisesti sen alkuperäiseen tiheyteen, joka tunnetaan nimellä implosiointimenetelmä. Imusointimenetelmää käytetään vain plutoniumilla eikä se toimi uraanin kanssa. Uraanin kohdalla aseen menetelmä on suositumpi.