Keskeinen ero: Automaattinen toisto tutkii äskettäin löydettyjä siirrettäviä tietovälineitä ja laitteita ja käynnistää sopivan sovelluksen sisällön toistamiseen tai näyttämiseen. Autorun havaitsee median autorun.if-tiedoston ja suorittaa tiedoston mukaiset ohjeet.
Me törmänmme termeihin "autoplay" ja "autorun" usein käsitellessäsi tietokoneita ja monet ihmiset, jotka eivät ole niin tech-tajuja, sekoittavat nämä kaksi. Vaikka nämä sanat ovat keskenään samanlaisia, ne eroavat toisistaan. Ne toimivat myös eri tavalla sen mukaan, minkä tyyppinen käyttöjärjestelmä on tällä hetkellä käytössä.
Automaattitoiminnon ansiosta ei-teknikot pystyivät asentamaan tiedoston asettamalla CD-levyn CD-lokeroon. tämä kuitenkin myös vähentää tietokoneiden turvallisuutta. Esimerkiksi: jos CD-levy käynnistetään järjestelmään, siinä on virus sekä autorun-tiedosto, järjestelmä jatkaa ja suorittaa tiedoston ja lataa viruksen järjestelmään. Jos kyseessä on Autoplay, se pyytää käyttäjältä lupaa ladata yksi tai useampi tiedosto CD-levyltä. Autoplay on kehitetty enemmän musiikin, videoiden ja kuvien tiedostoille. Järjestelmässä on käsittelijöiden järjestelmä, joka pystyy käsittelemään tämän tyyppistä mediaa.