Keskeinen ero: Koagulointi tarkoittaa kuristumista; se tarkoittaa periaatteessa kemiallista prosessia, jossa ei-laskeutuvien hiukkasten epävakautuminen tapahtuu. Nämä hiukkaset muodostavat kouristuksia koagulantin avulla. Toisaalta flokkulointivälineet muodostavat flokkeja. Sitä voidaan kuvata fysikaaliseksi tai mekaaniseksi prosessiksi, jossa koaguloidut kokkareet tai flokit on liitetty yhteen muodostaakseen massoja pilvinä ja sitten saostumana.
Vesi voi sisältää kolloidisia kiinteitä aineita, kuten ei-laskeutuvia orgaanisia aineita, savihiukkasia, bakteereita, planktonia, pieniä hajotetun kasvimateriaalin hiukkasia jne. Siten käytetään hyytymis- ja flokkulointitekniikoita näiden epäpuhtauksien erottamiseksi vedestä.
Koagulointi saadaan aikaan neutraloimalla hiukkaset ja siten hiukkasten välinen tukeva voima pienenee huomattavasti. Flokkulointimenetelmän käyttämisen jälkeen koaguloidut hiukkaset muodostavat suuren agglomeraation, joka tunnetaan myös nimellä floc.
Flokulaatiossa nämä epävakautettujen hiukkasten agglomeraatiot muodostuvat suurista hiukkasista. Tämä voidaan saavuttaa myös lisäämällä suurimolekyylipainoisia, vesiliukoisia orgaanisia polymeerejä. Näiden polymeerien vuoksi flokin koko kasvaa ja sitten hiukkaset laskeutuvat. On erittäin tärkeää, että flokkulointiaine sekoitetaan varovasti hitaalla nopeudella niin, että pienet flokit voivat helposti agglomeroitua suuriksi hiukkasiksi ja lopulta laskeutua.
Vedenkäsittelyä varten hyytymistä seuraa yleensä flokkulointi.
Niinpä vedenkäsittelyn osalta molemmat voidaan erottaa helposti. Koaguloitumisen aikana lisätään koagulanttia hiukkasten puristamiseksi yhteen. Toisaalta flokkuloitumisen aikana liuos sekoitetaan varovasti, niin että koaguloitumisen aikana muodostuneet pienet murtumat kerääntyvät yhteen ja muodostavat suurempia murtumia. Nämä suuret murtumat helposti laskeutuvat ja voidaan siten erottaa toisistaan.